Serveis cientificotècnics

Unitat de Disseny, Anàlisi i Interpretació – Òmica

La Unitat de Disseny, Anàlisi i Interpretació - Òmica (DAI-Omics) proporciona assistència individualitzada per al disseny, l'anàlisi i la interpretació d'estudis genòmics realitzats en l'àmbit de la recerca biomèdica. La Unitat DAI-Omics integra la capacitat científica en el camp de la genòmica i la bioinformàtics amb l'experiència i el coneixement de les bases genètiques i el context clínic de les patologies humanes.

La Unitat DAI-Omics ofereix suport als investigadors de l'Institut de Recerca Sant Joan de Déu Barcelona i de l'Hospital Sant Joan de Déu, així com a institucions externes.

La Unitat DAI-Omics proporciona un servei global que inclou:

  • Assessorament per al Disseny experimental

    amb Consell Genòmic enfocat a la planificació dels estudis genòmics tenint en compte la finalitat, la disponibilitat de mostres, les plataformes (tecnologia) genòmiques amb un enfoc cost efectiu.
  • L'Anàlisi de dades Òmiques (Big Data)

    mitjançant l'anotació de dades, un work-flow bioinformàtic optimitzat i eines web específiques per a cada tipus de dades.
  • La Interpretació i integració de les dades

    des de el punt de vista biomèdic el context del pla de recerca i del coneixement científic.

La Unitat DAI-Omics també proporciona assistència per a la integració dels resultats obtinguts a articles científics, així com assistència per a la preparació i dipòsit de les bases genòmiques en repositoris públics de dades de referència.

Principals Funcions

  • Disseny
    • Definir els objectius i el pla de recerca
    • Mostres (Cohorts, tipus i referència)
    • Disseny experimental
    • Plataforma / tecnologia adequada
  • Anàlisi
    • Pipeline Optimitzat: filtratge, normalització i control de qualitat
    • Processament i anàlisi de dades
    • Genòmica funcional
    • Mineria de dades
  • Interpretació
    • Anàlisi òmics personalitzats
    • Configuració UCSC Genome Browser
    • Comparació amb bases de dades públiques
    • Suport per escriure les seccions relacionades en els manuscrits
    • Preparació i dipòsit de les dades en repositoris públics