Unitat de Disseny, Anàlisi i Interpretació – Òmica

La Unitat de Disseny, Anàlisi i Interpretació - Òmica (DAI-Omics) proporciona assistència individualitzada per al disseny, l'anàlisi i la interpretació d'estudis genòmics realitzats en l'àmbit de la recerca biomèdica. La Unitat DAI-Omics integra la capacitat científica en el camp de la genòmica i la bioinformàtics amb l'experiència i el coneixement de les bases genètiques i el context clínic de les patologies humanes.

La Unitat DAI-Omics ofereix suport als investigadors de l'Institut de Recerca Sant Joan de Déu Barcelona i de l'Hospital Sant Joan de Déu, així com a institucions externes.

La Unitat DAI-Omics proporciona un servei global que inclou:

• Assessorament per al Disseny experimental

  amb Consell Genòmic enfocat a la planificació dels estudis genòmics tenint en compte la finalitat, la disponibilitat de mostres, les plataformes (tecnologia) genòmiques amb un enfoc cost efectiu.

• L'Anàlisi de dades Òmiques (Big Data)

  mitjançant l'anotació de dades, un work-flow bioinformàtic optimitzat i eines web específiques per a cada tipus de dades.

• La Interpretació i integració de les dades

  des de el punt de vista biomèdic el context del pla de recerca i del coneixement científic.

Principals Funcions

• Disseny
  • Definir els objectius i el pla de recerca
  • Mostres (Cohorts, tipus i referència)
  • Disseny experimental
  • Plataforma / tecnologia adequada
• Anàlisi
  • Pipeline Optimitzat: filtratge, normalització i control de qualitat
  • Processament i anàlisi de dades
  • Genòmica funcional
  • Mineria de dades
• Interpretació
  • Anàlisi òmics personalitzats
  • Configuració UCSC Genome Browser
  • Comparació amb bases de dades públiques
  • Suport per escriure les seccions relacionades en els manuscrits
  • Preparació i dipòsit de les dades en repositoris públics