Epigenètica del Càncer Pediàtric
Programa de recerca
Caps de grup
On som
Hospital Sant Joan de Déu Barcelona
Webs relacionades
Els tumors del desenvolupament són biològicament diferents dels càncers d'adults: no mostren alts nivells d'acumulació mutacional, sinó que es caracteritzen per una desregulació epigenètica. En el grup Epigenètica del Càncer Pediàtric ens fem preguntes fonamentals sobre la biologia dels tumors del desenvolupament: Com condueix la desregulació epigenètica a la cancerogènesi? Quines cèl·lules progenitores són susceptibles de transformació maligna impulsada per l'epigenètica? Què fa que aquests progenitors siguin especialment susceptibles i es pot revertir la seva transformació?
El nostre objectiu general és identificar les vulnerabilitats epigenòmiques específiques dels tumors del desenvolupament i explotar-les en la recerca de teràpies personalitzades per millorar el benestar i el pronòstic del pacient. Creiem que un mateix tractament no serveix per a tots, i hem de tractar a l'individu, no a la malaltia.
El grup se centra principalment en els tumors rabdoides malignes (MRT): càncers pediàtrics altament malignes i heterogenis, caracteritzats per l'activació bial·lèlica de la subunitat SMARCB1 del complex remodelador de cromatina SWI/SNF. La pèrdua funcional de SMARCB1 és l'única alteració recurrent en els MRT, el que els converteix en l'exemple més pur de tumorigènesi impulsada epigenèticament fins a la data.
Línies de recerca
- L'epigenoma dels MRT s'altera com a resultat de la pèrdua funcional de SMARCB1. No obstant això, es desconeix quin dels nombrosos canvis és el responsable de la transformació maligna. Utilitzant enfocaments (epi) genòmics i edició de gens, estem separant els canvis epigenòmics que impulsen la transformació maligna d'aquells que són mers espectadors. Amb aquest coneixement, enfocarem el desenvolupament terapèutic per apuntar als impulsors d'aquesta malaltia.
- Els MRT són una malaltia molt heterogènia que pot sorgir en múltiples òrgans. No obstant això, les cèl·lules d'origen de la malaltia segueixen sent enigmàtiques. Utilitzant mètodes de rastreig de llinatge i biologia computacional, estem investigant els orígens de diferents subtipus de MRT.
- Alguns MRT tenen un abundant infiltrat de cèl·lules immunitàries, mentre que altres són completament immunes al fred. Estem investigant la font d'immunogenicitat en els tumors MRT i avaluant com podria aprofitar-se per al tractament (per exemple, mitjançant immunoteràpia).
Objectius científics
- Caracteritzar l'heterogeneïtat de la malaltia de MRT en els nivells cel·lular, transcriptòmica i epigenètic per ajudar a la subclassificació de la malaltia i l'estratificació dels pacients.
- Identificar les aberracions epigenòmiques dels MRT que causen la transformació maligna.
- Avaluar si les alteracions epigenòmiques "transeünts" podrien explotar-terapèuticament.
- Identificar la cèl·lula d'origen de diferents subtipus de MRT.
- Identificar la font d'immunogenicitat en subconjunts de MRT i avaluar si es pot explotar terapèuticament.
- Avaluar com la focalització epigenètica pot establir sinergies amb el tractament estàndard d'atenció per millorar el pronòstic del pacient.
Àmbit/Camp d'especialització
El nostre treball es basa en la multidisciplinarietat, promovent la integració de tècniques de biologia cel·lular i molecular, rastreig de llinatges, edició del genoma CRISPR/CAS9, citometria, microscòpia, genòmica del càncer (epi) i biologia computacional. El nostre equip té una àmplia experiència en enfocaments de biologia experimental i computacional.
L'estreta associació entre l'IRSJD i l'Hospital Sant Joan de Déu Barcelona té com a objectiu tancar la bretxa entre el laboratori i el llit, amb l'objectiu en última instància d'identificar nous punts d'intervenció terapèutica per millorar el pronòstic i el benestar del pacient
Membres del grup
-
Jefe de Grupo
-
Carlos Javier Rodriguez Hernandez
Investigador post-doc
-
Paula Bujosa Rodríguez
Investigador post-doc
Últimes publicacions
- Lorito N, Subbiani A, Smiriglia A, Bacci M, Bonechi F, Tronci L, Romano E, Corrado A, Longo DL, Iozzo M, Ippolito L, Comito G, Giannoni E, Meattini I, Avgustinova A, Chiarugi P, Bachi A and Morandi A FADS1/2 control lipid metabolism and ferroptosis susceptibility in triple-negative breast cancer. EMBO Molecular Medicine . 16(7): 1533-1559.
- Sanchez-Guixe E, Muiños F, Pinheiro-Santin M, González-Huici V, Rodriguez-Hernandez CJ, Avgustinova A, Lavarino C, González- Pérez A, Mora J and López-Bigas N Origins of Second Malignancies in Children and Mutational Footprint of Chemotherapy in Normal Tissues CANCER DISCOVERY . 14(6): 953-964.
- Llorente A, Blasco MT, Espuny I, Guiu M, Ballaré C, Blanco E, Caballé A, Bellmunt A, Salvador F, Morales A, Nuñez M, Loren G, Imbastari F, Fidalgo M, Figueras-Puig C, Gibler P, Graupera M, Monteiro F, Riera A, Holen I, Avgustinova A, Di Croce L and Gomis RR MAF amplification licenses ERa through epigenetic remodelling to drive breast cancer metastasis NATURE CELL BIOLOGY . : 1833-1847.
Projectes
- Nom del projecte:
- ONCO-COMP_Oncogenic competence during development – When, Where and Why?
- Investigador/a principal
- Alexandra Avgustinova
- Entitat/es finançadora/es:
- European Commission, Fundació Privada per a la Recerca i la Docència Sant Joan de Déu - FSJD, Rodriguez Hernandez, Carlos Javier
- Codi
- 101076506
- Data de inici-fi:
- 2023 - 2028
- Nom del projecte:
- GLEBioassay_Nano-Monitoring of Cancer Immunotherapy Efficiency: The Lateral Electrophoretic Bioassay platform.
- Investigador/a principal
- Carlos Javier Rodriguez Hernandez
- Entitat/es finançadora/es:
- Instituto de Salud Carlos III (ISCIII)
- Codi
- AC21_2/00045
- Data de inici-fi:
- 2022 - 2024
- Nom del projecte:
- Ayudas para contratos predoctorales para la formación de doctores 2021
- Investigador/a principal
- Alexandra Avgustinova
- Entitat/es finançadora/es:
- Ministerio de Economía Y Competitividad (MINECO)
- Codi
- PRE2021-098532
- Data de inici-fi:
- 2022 - 2024
Notícies
-
L’IRSJD i l’IRB Barcelona reforcen la seva col·laboració en la recerca del càncer pediàtric
L'acord contempla l'obertura d'un laboratori, dirigit per la Dra. Alexandra Avgustinova, que cercarà les vulnerabilitats específiques dels tumors del desenvolupament per descobrir nous enfocaments terapèutics. El laboratori compartit d'Epigenètica del Càncer Pediatric se situarà a les instal·lacions de l'IRB Barcelona.
-
Nova identitat corporativa i web de la Xarxa de Bancs de Tumors de Catalunya
La Xarxa de Bancs de Tumor de Catalunya (XBTC) ha renovat la seva identitat corporativa i web amb l'objectiu de projectar una xarxa més dinàmica i propera en l'ecosistema de la biomedicina i la salut.
-
La Dra. Alexandra Avgustinova ha rebut la XXV Beca FERO per la recerca en tumors rabdoides malignes
La Dra. Alexandra Avgustinova ha estat la guanyadora de la XXV Beca FERO, per un treball de recerca que busca desenvolupar noves vies de tractament per als tumors rabdoides malignes (TRM), un dels càncers pediàtrics més agressius.