Unidad de Diseño, Análisis e Interpretación en Genómica Microbiana

La unidad de Diseño, Análisis e Interpretación en Genómica Microbiana integra la experiencia y el conocimiento científico en el campo de la microbiología clínica, la secuenciación masiva y la bioinformática para proporcionar asistencia individualizada para el diseño, el procesamiento de muestras, el análisis de datos y la interpretación de estudios de genómica microbiana en el ámbito de la investigación biomédica.

Servicios

La unidad ofrece apoyo a investigadores del Institut de Recerca Sant Joan de Déu y el Hospital Sant Joan de Déu, Barcelona, ​​así como a instituciones externas, e incluye:

1. Asesoramiento para diseño experimental. Consejo para la planificación de estudios de genómica microbiana teniendo en cuenta el objetivo y las hipótesis de estudio; la disponibilidad, el tipo y el número de muestras; la tecnología de secuenciación y los análisis bioinformáticos; siempre siguiendo un enfoque coste-efectivo.
2. Procesamiento de muestras biológicas. Extracción de DNA y RNA de muestras biológicas siguiendo el protocolo de laboratorio más adecuado para optimizar la cantidad de ácido nucleico obtenida.
3. Análisis de los datos de secuenciación. Procesamiento de los datos de secuenciación siguiendo el work-flow de análisis más adecuado de acuerdo con el diseño, objetivo e hipótesis de estudio y el tipo de datos de secuenciación obtenidos.
4. La interpretación y la integración de los datos. Interpretación de los resultados obtenidos en un contexto biomédico acorde con el diseño y los planteamientos del estudio. La unidad también ofrece asistencia en la integración de los resultados obtenidos en la redacción de artículos científicos y en el correspondiente depósito de los datos de secuenciación generados en depositarios públicos adecuados.

Tarifas

• Personal investigador vinculado a SJD (IRSJD u Hospital): 80€/muestra
• Personal investigador no vinculado a SJD (IRSJD u Hospital) con proyectos competitivos públicos: 100€/muestra
• Personal investigador no vinculado a SJD (IRSJD u Hospital) con proyectos privados: 120€/muestra